Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Timm29Q8BGX2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timm29Q8BGX2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms