Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af1l4Q8BGJ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
U2af1l4Q8BGJ9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms