Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh3bgrl2Q8BG73 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms