Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.3Q85ZW6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.3Q85ZW6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms