Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Srgap3Q812A2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srgap3Q812A2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms