Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg4cQ811C2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg4cQ811C2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms