Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Negr1Q80Z24 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Negr1Q80Z24 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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