Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Npm2Q80W85 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Npm2Q80W85 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms