Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms