Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actr5Q80US4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms