Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab3gap1Q80UJ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms