Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Avl9Q80U56 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Avl9Q80U56 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms