Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arhgef17Q80U35 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Arhgef17Q80U35 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Arhgef17Q80U35 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgef17Q80U35 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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