Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PhkbQ7TSH2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PhkbQ7TSH2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PhkbQ7TSH2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms