Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSE6

Stk38l, Serine/threonine-protein kinase 38-like, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk38lQ7TSE6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stk38lQ7TSE6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk38lQ7TSE6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms