Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RgmbQ7TQ33 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RgmbQ7TQ33 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms