Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim17Q7TPM3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms