Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphp3Q7TNH6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphp3Q7TNH6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp3Q7TNH6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms