Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd1l2Q7TN88 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd1l2Q7TN88 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms