Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF2

Eri1, 3'-5' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri1Q7TMF2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eri1Q7TMF2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eri1Q7TMF2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms