Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms