Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nemp1Q6ZQE4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms