Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

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Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Glis3Q6XP49 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Glis3Q6XP49 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Glis3Q6XP49 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms