Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P4ha3Q6W3F0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P4ha3Q6W3F0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms