Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Opn5Q6VZZ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn5Q6VZZ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms