Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tfap2eQ6VUP9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tfap2eQ6VUP9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms