Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Rhox8Q6VSS7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rhox8Q6VSS7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rhox8Q6VSS7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms