Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc154Q6RUT8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms