Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GcsamQ6RFH4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GcsamQ6RFH4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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