Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff1Q6PFE7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms