Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a1Q6PEM8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms