Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc85bQ6PDY0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc85bQ6PDY0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms