Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm2lQ6PDS0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms