Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd4Q6PDQ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chd4Q6PDQ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms