Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ttbk1Q6PCN3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ttbk1Q6PCN3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttbk1Q6PCN3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttbk1Q6PCN3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms