Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Herc4Q6PAV2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Herc4Q6PAV2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms