Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AtminQ6P9S1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AtminQ6P9S1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms