Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BC061212Q6P8K3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BC061212Q6P8K3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms