Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcnpQ6P8I4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnpQ6P8I4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms