Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gga2Q6P5E6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga2Q6P5E6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga2Q6P5E6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga2Q6P5E6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga2Q6P5E6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga2Q6P5E6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga2Q6P5E6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga2Q6P5E6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga2Q6P5E6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga2Q6P5E6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms