Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp12Q6P5B0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms