Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm2bQ6P1G2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm2bQ6P1G2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm2bQ6P1G2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms