Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rprd2Q6NXI6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rprd2Q6NXI6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms