Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc3bQ6NWW9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc3bQ6NWW9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms