Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HelbQ6NVF4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HelbQ6NVF4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms