Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RragbQ6NTA4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RragbQ6NTA4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms