Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParpbpQ6IRT3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms