Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms