Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrcc1Q69ZB0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrcc1Q69ZB0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms