Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn4Q69Z26 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn4Q69Z26 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms